先說對水質的規定，每個標準都是與時俱進的，規定項目越來越多，越來越詳細，絕大部分項目要求的數值都是越來越嚴格的，以適應和推廣先進工藝的普及。飲用水標準目前多數指標要求是持平歐美的標準，少數比歐美寬松。

  由于客觀上水體在被污染，有些物質的總體含量是越來越高并且難以在現有主流工藝中除去的，比如某些有機物，這時候會考慮到標準的可執行度，放寬對該物質的標準數值要求。這算是一個不得已的缺陷。

  另外，一些重金屬之類的要求低于0.0001mg/L的指標，實際儀器的檢測精度都達不到，只能測到0.001，所以實際執行的時候就成了不得檢出，因為檢出就是超標10倍了，同時也說明沒檢出也可能超標幾倍。所以實際執行不到那么高的標準。

  還有個缺陷，目前水質中沒有對總含鹽量的規定，政府正在考慮加入，但由于反滲透等脫鹽工藝的大量運行，濃鹽水問題越來越大，水中含鹽量遠高于周邊水系，排入后會造成水體中生物死亡，破壞生物鏈，同時可能使河床鹽堿化。
如果規定了含鹽量，這些濃鹽水就無處可去，要么水量小被企業找地方用掉，要么水量大用不掉只能蒸發結晶弄成固體，成本相當高，大部分企業承受不起。加入含鹽量限制會打壓脫鹽行業的發展，但脫鹽是目前獲取高品質水的最低成本的方法，如果打壓，很多需求高品質水的行業就沒法過了。也是個糾結的題目。

  再說對標準檢測方法的規定。為了普適性，標準中的檢測方法大多是傳統方法，國標法。

  而實際應用中，有很多公司開發的檢測儀器使用不同測定方式甚至不同測定原理的快速測定法，因為快速或簡便，應用范圍比國標法要廣。通常規定，其他檢測方法要和國標的對比，多次測定后誤差控制在一定范圍內，檢測才能被認可，并且儀器要明確說明與國標法的誤差范圍。

從這點來說，標準規定的檢測方法常常只是個標桿，而不是工具。